使えなくなるタグ

具体的に一番使えなくなっているケースが多いと思われるのが、<div>,<span> 内などでの style 属性かと思います。これまで style="..." というご指定をされていた方、大変ご迷惑をおかけします。
この場合は、設定画面の「スタイルシート」欄で div.hoge (hogeは適当な名称）を定義して頂き、<div class="hoge">文字列</div> として頂ければと思います。